Всего по Зеленограду проголосовало 8,63% от общего числа избирателей. Протестное голосование (против всех кандидатов), в отличие от первого тура выборов, было невысоким - 3,54%. Выборы состоялись во всех 13 округах, и все остававшиеся свободными 18 депутатских мест заполнены. Таким образом, в МО Силино и Крюково начали работу новые составы муниципальных Собраний.
По сообщениям из Московской городской избирательной комиссии, все 125 муниципальных Собраний Москвы сформированы полностью.

Результаты повторных выборов депутатов муниципальных Собраний 16 мая 2004 года
МО Матушкино, избирательный округ №3. Избран ШАМИН Андрей Иванович, директор ГУП ДЕЗ №1. За кандидата подано 55,8% голосов. Против всех кандидатов - 4,13%.
МО Савёлки, избирательный округ №1. Избраны: ЕЛМАНОВ Владимир Николаевич, директор ГДЕЗ (80,6%), ЮЛГУШЕВ Марат Рифатович, директор СДЮШОР №111 (71,78%). Против всех - 3,7%.
МО Савёлки, избирательный округ №2. Избран НИКОНОВ Игорь Валерьевич, студент МИЭТа (41,72%). Против всех - 4,73%.
МО Савёлки, избирательный округ №4. Избран ЧЕРНЯЕВ Виктор Вячеславович, генеральный директор ООО «Фон-Маркет» (48,13%). Против всех - 1,37%.
МО Старое Крюково, избирательный округ №1. Избран КУЛИН Николай Александрович, преподаватель СДЮШОР №112 (95,01%). Против всех - 2,37%.
МО Силино, избирательный округ №1. Избраны: МУХА Евгений Владимирович, мастер ГУП «Электроремонт» (51,68%), СЛИСЕНКО Татьяна Валентиновна, директор ГУП РЭУ №8 (51,68%). Против всех - 2,07%.
МО Силино, избирательный округ №2. Избраны: АВРАМЕНКО Наталья Юрьевна, директор ГК «Радуга» (56,47%), ЯСИНОВА Анна Владимировна, директор  школы №1692 (56,47%). Против всех - 3,82%.
МО Силино, избирательный округ №4. Избрана ПАНТЕЛЕЙМОНОВА Эльмира Сабировна, директор ГОУ ДЮЦ «Союз» (58,85%). Против всех - 4,23%.
МО Силино, избирательный округ №6. Избрана ТОКМОВЦЕВА Маргарита Владимировна, заведующая кафедрой МИДА (68,6%). Против всех - 4,1%.
МО Силино, избирательный округ №7. Избран НОВИКОВ Владимир Никитович, заместитель начальника цеха ОАО «Логика» (70,63%). Против всех - 2,31%.
МО Крюково, избирательный округ №1. Избраны: АГАПОВ Игорь Геннадьевич, директор школы №1151 (59,31%), ЕВСЕЕВ Анатолий Васильевич, фотокорреспондент газеты «41» (50,49%). Против всех - 1,88%.
МО Крюково, избирательный округ №5. Избраны: БЫКОВА Наталья Валерьевна, директор аптеки №244 (52,45%), ШАТИЛОВ Виктор Иванович, заместитель декана МИЭТа (55,68%). Против всех - 4,35%.
МО Крюково, избирательный округ №7. Избран ФРОЛЕНКОВ Алексей Евгеньевич, предприниматель без образования юридического лица (57,95%). Против всех - 8,05%.